python社区发现_网络算法系列之社区发现(一):标签传播算法-程序员宅基地

技术标签: python社区发现  

社区发现简介

社区发现问题实际上是从子图分割的问题演变而来。在社交网络中,有些用户连接非常紧密,有些用户连接较为稀疏,这些连接紧密的用户可以看做一个社区,而社区之间连接较为稀疏。下图就展示了一个社区发现。

1

目前的社区发现问题分为两大类:非重叠社区发现和重叠社区发现。非重叠社区发现问题描述的是:一个网络中,每个节点均只能属于同一个社区,这意味这社区和社区之间是没有交集的。在非重叠社区发现算法中,有不同种类的解法:

1、基于模块度的社区发现算法

基本思想是通过定义模块度(Modularity)来衡量一个社区的划分是不是相对比较好的结果,从而将社区发现问题转化为最大化模块度的问题进行求解。这块后续会讲到。

2、基于标签传播的社区发现算法

基本思想是通过标记节点的标签信息来更新未标记节点的标签信息,在整个网络中进行传播,直至收敛。其中最具代表性的就是标签传播算法(LPA,Label Propagation Algorithm)。

标签传播算法

简介

标签传播算法是一种基于标签传播的局部社区发现算法。其基本思想是节点的标签(community)依赖其邻居节点的标签信息,影响程度由节点相似度决定,并通过传播迭代更新达到稳定。原始论文可以参考:

Near linear time algorithm to detect community structures in large-scale networks。

算法详述

算法过程

初始化阶段:每个节点都会初始化自己作为社区标签。

传播阶段:遍历网络中所有的节点,找到当前节点的所有邻居节点。获取所有邻居节点的社区标签,并找到权重最大(投票思想)的社区标签(对于有权图,就是所有同社区标签的edge weight之和;对于无权图,edge weight看做是1,就是出现次数做多的社区标签),将其为更新自己的社区标签。

收敛判定阶段:遍历网络中所有的节点,找到当前节点的所有邻居节点。获取所有邻居节点的社区标签,并找到权重最大的社区标签,判定是否是自己的社区标签,如果均判定通过,则算法结束。为防止震荡情况出现,应设置一个最大迭代次数。达到最大迭代次数后也退出。

在社区标签传播的阶段,如果我们将每个邻居

标签传播方式

标签传播方式分为两种:同步更新、异步更新。

1、同步更新:在第

equation?tex=t次迭代中,每个节点依赖的都是邻居节点上一次迭代

equation?tex=t-1时的社区标签。

2、异步更新:在第

equation?tex=t次迭代中,每个节点依赖的是当前邻居节点的社区标签,若邻居节点进行了更新,则依赖的是

equation?tex=t时的社区标签,若未进行更新,则依赖的是

equation?tex=t-1时的社区标签。

优缺点

优点

1、算法逻辑简单,时间复杂度低,接近线性复杂度,在超大规模网络下会有优异的性能,适合做baseline。

2、无须定义优化函数,无须事先指定社区个数,算法会利用自身的网络结构来指导标签传播。

缺点

1、雪崩效应:社区结果不稳定,随机性强。由于当邻居节点的社区标签权重相同时,会随机取一个。导致传播初期一个小的错误被不断放大,最终没有得到合适的结果。尤其是异步更新时,更新顺序的不同也会导致最终社区划分结果不同。

1

举个例子,上图中展示了一次标签传播算法的流程。

初始化阶段,每个节点都以自己作为社区标签。比如a的社区就是a,c的社区就是c。当进入传播阶段,节点c的邻居节点共4个:a,b,c,d。而社区标签也是4个:a,b,c,d,假设随机取了一个a。如果是异步更新,此时b,d,e三个节点的邻居节点中社区标签均存在2个a,所以他们都会立马更新成a。如果c当时随机选择的是b,那么d,e就会更新成b,从而导致b社区标签占优,而最终的社区划分也就成b了。

2、震荡效应:社区结果来回震荡,不收敛。当传播方式处于同步更新的时候,尤其对于二分图或子图存在二分图的结构而言,极易发生。

1

举个例子,上图中展示了一次二分图中标签传播算法的流程。

在同步更新的时候,每个节点依赖的都是上一轮迭代的社区标签。当二分图左边都是a,右边都是b时,a社区的节点此时邻居节点都是b,b社区的节点此时邻居节点都是a,根据更新规则,此时a社区的节点将全部更新为b,b社区的节点将全部更新为a。此时算法无法收敛,使得整个网络处于震荡中。

算法实现

输入数据格式

采用的是边表的数据格式,即数据共三列,分别是node_in、node_out、edge_weight。

python代码

#!/usr/bin/env python3

# -*- coding: utf-8 -*-

import matplotlib.pyplot as plt

import pandas as pd

import numpy as np

import string

def loadData(filePath):

f = open(filePath)

node_dict = {}

edge_list_dict = {}

for line in f.readlines():

lines = line.strip().split("\t")

for i in range(2):

if lines[i] not in node_dict:

node_dict[lines[i]] = (lines[i]) # 每个节点的社区标签就是自己

edge_list = [] # 存放每个节点的所有邻居节点及边权重

if len(lines) == 3:

edge_list.append(lines[1 - i] + ":" + lines[2])

else:

edge_list.append(lines[1 - i] + ":" + "1") # 无权图默认权重是1

edge_list_dict[lines[i]] = edge_list

else:

edge_list = edge_list_dict[lines[i]]

if len(lines) == 3:

edge_list.append(lines[1 - i] + ":" + lines[2])

else:

edge_list.append(lines[1 - i] + ":" + "1")

edge_list_dict[lines[i]] = edge_list

return node_dict, edge_list_dict

def get_max_community_label(node_dict, adjacency_node_list):

label_dict = {}

for node in adjacency_node_list:

node_id_weight = node.strip().split(":")

node_id = node_id_weight[0]

node_weight = int(node_id_weight[1])

# 按照label为group维度,统计每个label的weight累加和

if node_dict[node_id] not in label_dict:

label_dict[node_dict[node_id]] = node_weight

else:

label_dict[node_dict[node_id]] += node_weight

sort_list = sorted(label_dict.items(), key=lambda d: d[1], reverse=True) # 返回weight累加和最大的社区标签

return sort_list[0][0]

def check(node_dict, edge_dict):

for node in node_dict.keys():

adjacency_node_list = edge_dict[node] # 获取该节点的邻居节点

node_label = node_dict[node] # 获取该节点当前label

label = get_max_community_label(node_dict, adjacency_node_list) # 从邻居节点列表中选择weight累加和最大的label

if node_label >= label:

continue

else:

return 0 # 找到weight权重累加和更大的label

return 1

def label_propagation(node_dict, edge_list_dict, iteration_max):

t = 0

while True:

if t > iteration_max:

break;

# 收敛判定阶段

if (check(node_dict, edge_list_dict) == 0):

t = t + 1

print ('iteration: ', t)

# 每轮迭代都更新一遍所有节点的社区label

for node in node_dict.keys():

# adjacency_node_list存放该节点的所有邻居节点及边权重

adjacency_node_list = edge_list_dict[node]

# 传播阶段,将所有邻居节点最大的社区标签更新为自己的社区标签

node_dict[node] = get_max_community_label(node_dict, adjacency_node_list)

else:

break

return node_dict

if __name__ == '__main__':

# 加载文件

filePath = 'xx/xx.txt'

print ("初始化阶段开始!")

# node_dict表示每个节点归属社区的状态,key是node,value是社区标签。

# edge_list表示每个节点的所有所有邻居节点及边权重,key是node,value是一个list,list中的每个item就是该node的一个邻居节点及边权重。

node_dict, edge_list_dict = loadData(filePath)

iteration_max = 1000 # 设置最大迭代次数

print ("初始化阶段结束!")

print ("标签传播算法开始!")

node_dict = label_propagation(node_dict, edge_list_dict, iteration_max)

print ("标签传播算法结束!")

print ("最终的结果为:")

print (node_dict)

复制代码

优化方向

初始化阶段改进

人工标注或者采用算法提取一些紧密的子结构,确定好网络社区的雏形,再进行传播。

传播阶段改进

根据具体的业务场景,仔细定义边权重edge_weight,点权重node_weight,优化标签传播的传播优先度,一个良好的权重定义可以隐式的划分网络结构,更有利于社区发现。

版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接:https://blog.csdn.net/weixin_39611047/article/details/110377689

智能推荐

Docker 快速上手学习入门教程_docker菜鸟教程-程序员宅基地

文章浏览阅读2.5w次,点赞6次,收藏50次。官方解释是,docker 容器是机器上的沙盒进程,它与主机上的所有其他进程隔离。所以容器只是操作系统中被隔离开来的一个进程,所谓的容器化,其实也只是对操作系统进行欺骗的一种语法糖。_docker菜鸟教程

电脑技巧:Windows系统原版纯净软件必备的两个网站_msdn我告诉你-程序员宅基地

文章浏览阅读5.7k次,点赞3次,收藏14次。该如何避免的,今天小编给大家推荐两个下载Windows系统官方软件的资源网站,可以杜绝软件捆绑等行为。该站提供了丰富的Windows官方技术资源,比较重要的有MSDN技术资源文档库、官方工具和资源、应用程序、开发人员工具(Visual Studio 、SQLServer等等)、系统镜像、设计人员工具等。总的来说,这两个都是非常优秀的Windows系统镜像资源站,提供了丰富的Windows系统镜像资源,并且保证了资源的纯净和安全性,有需要的朋友可以去了解一下。这个非常实用的资源网站的创建者是国内的一个网友。_msdn我告诉你

vue2封装对话框el-dialog组件_<el-dialog 封装成组件 vue2-程序员宅基地

文章浏览阅读1.2k次。vue2封装对话框el-dialog组件_

MFC 文本框换行_c++ mfc同一框内输入二行怎么换行-程序员宅基地

文章浏览阅读4.7k次,点赞5次,收藏6次。MFC 文本框换行 标签: it mfc 文本框1.将Multiline属性设置为True2.换行是使用"\r\n" (宽字符串为L"\r\n")3.如果需要编辑并且按Enter键换行,还要将 Want Return 设置为 True4.如果需要垂直滚动条的话将Vertical Scroll属性设置为True,需要水平滚动条的话将Horizontal Scroll属性设_c++ mfc同一框内输入二行怎么换行

redis-desktop-manager无法连接redis-server的解决方法_redis-server doesn't support auth command or ismis-程序员宅基地

文章浏览阅读832次。检查Linux是否是否开启所需端口,默认为6379,若未打开,将其开启:以root用户执行iptables -I INPUT -p tcp --dport 6379 -j ACCEPT如果还是未能解决,修改redis.conf,修改主机地址:bind 192.168.85.**;然后使用该配置文件,重新启动Redis服务./redis-server redis.conf..._redis-server doesn't support auth command or ismisconfigured. try

实验四 数据选择器及其应用-程序员宅基地

文章浏览阅读4.9k次。济大数电实验报告_数据选择器及其应用

随便推点

灰色预测模型matlab_MATLAB实战|基于灰色预测河南省社会消费品零售总额预测-程序员宅基地

文章浏览阅读236次。1研究内容消费在生产中占据十分重要的地位,是生产的最终目的和动力,是保持省内经济稳定快速发展的核心要素。预测河南省社会消费品零售总额,是进行宏观经济调控和消费体制改变创新的基础,是河南省内人民对美好的全面和谐社会的追求的要求,保持河南省经济稳定和可持续发展具有重要意义。本文建立灰色预测模型,利用MATLAB软件,预测出2019年~2023年河南省社会消费品零售总额预测值分别为21881...._灰色预测模型用什么软件

log4qt-程序员宅基地

文章浏览阅读1.2k次。12.4-在Qt中使用Log4Qt输出Log文件,看这一篇就足够了一、为啥要使用第三方Log库,而不用平台自带的Log库二、Log4j系列库的功能介绍与基本概念三、Log4Qt库的基本介绍四、将Log4qt组装成为一个单独模块五、使用配置文件的方式配置Log4Qt六、使用代码的方式配置Log4Qt七、在Qt工程中引入Log4Qt库模块的方法八、获取示例中的源代码一、为啥要使用第三方Log库,而不用平台自带的Log库首先要说明的是,在平时开发和调试中开发平台自带的“打印输出”已经足够了。但_log4qt

100种思维模型之全局观思维模型-67_计算机中对于全局观的-程序员宅基地

文章浏览阅读786次。全局观思维模型,一个教我们由点到线,由线到面,再由面到体,不断的放大格局去思考问题的思维模型。_计算机中对于全局观的

线程间控制之CountDownLatch和CyclicBarrier使用介绍_countdownluach于cyclicbarrier的用法-程序员宅基地

文章浏览阅读330次。一、CountDownLatch介绍CountDownLatch采用减法计算;是一个同步辅助工具类和CyclicBarrier类功能类似,允许一个或多个线程等待,直到在其他线程中执行的一组操作完成。二、CountDownLatch俩种应用场景: 场景一:所有线程在等待开始信号(startSignal.await()),主流程发出开始信号通知,既执行startSignal.countDown()方法后;所有线程才开始执行;每个线程执行完发出做完信号,既执行do..._countdownluach于cyclicbarrier的用法

自动化监控系统Prometheus&Grafana_-自动化监控系统prometheus&grafana实战-程序员宅基地

文章浏览阅读508次。Prometheus 算是一个全能型选手,原生支持容器监控,当然监控传统应用也不是吃干饭的,所以就是容器和非容器他都支持,所有的监控系统都具备这个流程,_-自动化监控系统prometheus&grafana实战

React 组件封装之 Search 搜索_react search-程序员宅基地

文章浏览阅读4.7k次。输入关键字,可以通过键盘的搜索按钮完成搜索功能。_react search