同源建模之I-TASSER
标签： bash
I-TASSER (Iterative Threading ASSEmbly Refinement)是一种用于蛋白质结构和功能预测方法。它首先通过多线程方法LOMETS从PDB中识别结构模板，并通过基于迭代模板的碎片组装模拟构建完整的原子模型。接着通过蛋白质...
”I-TASSER“ 的搜索结果
I-TASSER是一款用于预测蛋白质结构和功能的工具，网站链接：https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ 具体描述如下： I-TASSER (Iterative Threading ASSEmbly Refinement) is a hierarchical approach to ...
D-I-TASSER (Deep-learning based Iterative Threading ASSEmbly Refinement，即基于深度学习的迭代、穿线、组装、精调) ，从 I-TASSER 扩展的新方法，用于高精度的蛋白结构和功能预测。
目录Paper_Info预备知识：AbstractMotivation:Results:1 Introduction2 Methods2.1 Data2.2 基于 I-TASSER的结构构件2.3 Features extraction2.4 Convolutional neural networks2.5 aPRBind算法的体系结构2.6 ...
学习资料 教程（需要翻墙）： http://www.pyrosetta.org/tutorials ， http://www.meilerlab.org/index.php/jobs/resources 值得参考的博客博主：...在线计算平台： Robetta（多肽数>...
title: 关于SailVina中蛋白质的下载与受体提取的使用介绍 top: false cover: false toc: true mathjax: false date: 2021-01-07 23:11:07 password: summary: 关于SailVina中蛋白质的下载与受体提取的使用介绍 ...
按照我手头的工作所得到的结果对它们的性能进行排序：一：I-TASSER结果好得让我吃惊。二：SAM-T08结果和I-TASSER不相上下，不过反馈的邮件中，pdb文件不是以附件的形式发送，而是以邮件中的文字。coot往往不认这样的...
对一组反映AS病理生理过程的生物标记物进行多重分析，发现数种生物标记物可能是AS结构损害的预测因素，这有待进一步前瞻性研究证实。 原文 ...Biomarkers in Ankylosing Spondylitis: Identification of High ...
* Support: https://ubuntu.com/advantage 102 packages can be updated.53 updates are security updates. New release '18.04.2 LTS' available.Run 'do-release-upgrade' to upgrade to it. Last login: ...
6. 蛋白质结构预测软件：如I-TASSER，Phyre2，SWISS-MODEL等。 以上工具可以用于基因组组装、基因预测、基因注释、基因表达分析和蛋白质结构预测等分析任务。需要根据具体的研究问题选择合适的工具进行分析。
蛋白质模建的几种方法 同源模建 同源模建介绍 可用软件列表 Modeller Swiss-Model 折叠识别 从头预测 综合方法 实地操作
2020-12-16 03:25:07 AlphaFold2的胜利就像是一场接力赛，往往是跑到最后一棒的人会有更多的高光时刻。但是，我们依然要记住为这门学科贡献智慧的人。 来源 | 医健AI掘金志 ...尽管，距离Deepmind公司AlphaFold2...
可以使用结构预测工具，如I-TASSER、SWISS-MODEL等，通过比对已知的蛋白质结构库，来预测蛋白质的二级结构或者三维结构。通过对比预测结果与已知结构的相似性来评估预测的准确性。 4. 应用分析：根据预测结果，分析...
2020.3.12讲解日志 文献： Improving the prediction of protein–nucleic acids binding residues（蛋白质-核酸结合残基） via multiple sequence profiles（多序列预测） and the consensus of complementary ...
Rosetta模型 1.介绍 从头预测，来源于拉丁文ab initio或de novo，严格的讲，这两者是有区别的，前者ab initio意思是from tlIe beginning，指基于第一性原则(6rst principles)而不依靠同源序列、数据库、二级结构等...
他，是蛋白质结构领域“奥林匹克竞赛”——CASP（Critical Assessment of protein Structure Prediction）六连冠得主；他，是英国路透社评选的（15年和16年）“全球高引科学家”获得者；他，是横跨物理、生物、...
Web服务器名称 网址 简要描述;简介 agriGO v2 http://systemsbiology.cau.edu.cn/agriGOv2/ GO分析农业物种 AMMOS2 ... 能量最小化蛋白质 - 配体复合物 antiSMASH ... 细菌和真菌基因组中的次
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