以耐贮辣椒品系P98为材料，采用RACE方法...Blast比对发现，该基因核苷酸序列与已报道的番茄和番木瓜PG基因具有84％和85％的相似性。聚类分析表明，该基因与番茄和番木瓜的亲缘关系较近，与拟南芥PG基因的亲缘关系较远。
”序列相似性分析“ 的搜索结果
采用PCR扩增、克隆和序列测定等技术对厦门海域真刺唇角水蚤(Labidocera ...三条核苷酸序列经比较后，得到其遗传相似性(identity)为99.29％．共有15个差异位点．核苷酸差异均为颠换(transversion)类型．比较了厦门海域
结果表明,单轴载荷条件下煤体的声发射时间序列在各变形阶段具有明显的分形特征,各变形阶段的声发射过程具有不同的自相似性,其关联维数可描述煤样力学状态;三轴加载过程中,无瓦斯和含瓦斯煤样的声发射时间序列随应力...
通过限制性片段的折叠分析，完成了最后一组中免疫球蛋白结构域相似性的详细描述。 然后就以下方面讨论了数据：i）免疫球蛋白的折叠进化； ii）cd14066（IRAK）和PLN00113（LRR相关激酶）结构域对催化丝氨酸/苏氨酸/...
用设计的特异性引物,采用RT-PCR方法扩增到广西...比较分析广西黄鸡13种β-防御素Gal-1-Gal-13基因分别与GenBank中注册的防御素基因氨基酸序列的相似性,其氨基酸的相似性均在95.5%-100%之间。利用DNAStar软件对所获得的
生物信息序列比对算法
标签： 序列比对
而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物...
用细菌16S rDNA通用引物扩增出约1 500 by的条带,经DNA测序得到一条长1 499 by的16S rDNA序列,与GeneBank已提交的序列进行BLAST相似性搜索表明该微生物应归属于假单胞菌属(Pseudomonas),并用 DNAStar进行同源性分析并...
动态规划是序列分析中常用的一种算法技术。动态规划是用来当递归可以使用但会效率低下，因为它会重复解决相同的问题。例如，考虑斐波那契数列：0，1，1，2，3，5，8，13，…第一个和第二个Fibonacci数被定义为0和1，...
alpha-CENTAURI原则上可以在任何序列数据上运行，但是，如果基于与初始单体集的相似性对读数进行筛选，则其性能将大大提高。安装先决条件（您可能需要超级用户特权才能安装这些软件包）： g ++编译器python2.7 ...
其ITS序列具有高度相似性的同时具有一定差异;邹城1号和邹城4号、邹城2号和邹城3号、邹城5号和邹城49号在进化树上分别位于同一支,其亲缘关系分别较近;邹城1号、邹城2号、邹城3号和邹城4号聚为一支,有不同程度上的亲缘...
该研究对华南地区两个人工林豆科树种厚荚相思和卷荚相思的根瘤菌两个代表菌株HJ06和JJ06进行了16S rDNA全序列测定，将此全序列与根瘤菌各已知种及相关种的16S rDNA全序列进行了比较及聚类分析，得到系统发育树状图。...
插入片段全长2456bp，包含一段1314bp的没有内含子的蛋白质编码区，编码一个含438个氨基酸残基的多肽链，其氨基酸序列与来源于酿酒酵母的烯醇化酶相似性为74.3%。多重序列比对显示，产甘油假丝酵母烯醇化酶(CgENO1)...
时间序列是广泛存在的随机变量列，它以时间为指标，是一种特殊的随机过程。平稳序列是时间序列中的一种特殊序列，最大的特征是具有平稳性，即均值不随时间而变化，协方差只与时间差有关。
这些集合被分析用来了解长期发展趋势，为了预测未来或者表现分析的其他形式。但是什么时间序列？与常见的回归问题的不同？1、时间序列是跟时间有关的。所以基于线性回归模型的假设：观察结果是独立的。在这种情况下...
目录 1. 闵可夫斯基距离：...在机器学习中，经常需要比较个体间差异的大小，进而评价个体的相似性和类别。最常见的是数据分析中的相关分析，数据挖掘中的分类和聚类算法，如 K 最近邻（KNN）和 K 均值（K-Means）.
指对某种事物发展变化过程进行观测并按照一定频率采集得出的一组随机变量。...近年来，以卷积神经网络、循环神经网络和 Transformer模型为代表的深度学习算法在时间序列预测任务中取得了丰硕的成果。
以优化后的漆酶培养基为基础,通过RT-PCR和RACE技术相结合,从偏肿革裥菌Lenzites gibbosa菌株中获得编码漆酶基因的cDNA及Genomic DNA的全长序列,Genomic ...序列在氨基酸水平上与彩绒革盖菌Trametes versicolor的相似性
通过对任意序列之间相似性的定义，将序列影射到合适的高维空间当中，给出在高维特征空间当中序列之间的内积，构造出可选序列集的核矩阵，进而对跳频序列集进行聚类分析，发现序列集投影在特征空间中的聚类结构，进而...
时间序列算法总结...更新中
时间序列分析教程（一）：基本性质
标签： 时间序列
这个学期接触了时间序列分析，期末复习了几天，稍微总结一下写一个系列的文章，如果出现一些知识性错误或者迷惑的地方，欢迎交流。 时间序列分析，其实就是和自然语言处理一样对序列数据进行分析，只是这里的序列...
DTW最早是用于语音识别领域，然后被用于时间序列相似性度量，与k近邻分类器结合后用于时间序列分类，下面分析其实现代码： 01:public class DTW_kNN extends kNN { 02: private boolean opti...
序列分析发现和裂殖酵母的蛋白激酶dis1非常相似,比较两者3'氨基酸序列发现同源性达28%以上。其推断的氨基酸序列上包含有6个丝/苏氨酸蛋白激酶的保守亚区。这些都表明它编码的基因可能是一个新的丝/苏氨酸
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