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     生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写...

生信项目流程

标签:   python

     数据特征的选择是根据具体的项目进行选择的,不一定哪种数据特征提取的方法会好,也可以采用多视图特征融合的方法进行训练模型,以提高模型的性能。

     PRS(Polygenic risk score)也叫PGS(Polygenic score)是在GWAS基础上发展起来的,PRS(多基因风险评分)是将与某种表型相关联的一组风险SNP的基因型效应加权来计算个体对该种表型(多指患病表型)的倾向的遗传学...

     TCGA GEO数据处理,基因注释,差异分析,GO,KEGG,GSEA富集分析,肿瘤突变负荷,免疫浸润,LASSO回归,随机森林,SVM-RFE,COX回归,WGCNA网络,共识聚类分析,药物敏感性分析,干性指数,免疫浸润指数,预后模型等...

     【生信】第一章 何为生信? 北京大学生信导论笔记,部分作手册自查使用。如有错误或遗漏还请海涵,可评论或邮箱联系。最后修改时间:2020-03-29 00:03:36 星期日 一、概述(Sequence alignment) DNA/基因组:如何...

     整合了许多生信相关的网课链接,包括chip-seq信息分析,GEO分析高级教程多芯片联合分析,lncRNA芯片数据挖掘,TCGA基因表达和临床性状关系,TCGA基因差异表达分析转录因子调控网络,TCGA甲基化驱动基因高级课程

     生信技能树的创始人做的,有需求下载。生信技能树的创始人做的,有需求下载生信技能树的创始人做的,有需求下载

生信学习书籍

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     Bioinstrumentations involves biological variable measurements, this assists the physicians in treatment and diagnosis of their patients (Khandpur, 2004). In order to operate the equipment, electronics...

     该方法通过计算基因在样本间的差异表达,...这些差异分析方法在生信研究中发挥着重要作用,根据研究目的和数据类型的不同,选择合适的差异分析方法可以有效地鉴定差异基因或差异分子,并对生物学过程进行进一步的解析。

     conda分为anaconda和miniconda。anaconda是包含一些常用包的版本,miniconda则是精简版,需要啥装啥,所以推荐使用miniconda。InterPro是一个数据库,其提供蛋白序列的功能分析并归纳为一个个蛋白家族,同时还预测了...

     python练习题 1 在文件中创建字符串nN Create 10 strings in a file, for each string, the first half is n and the last half is N. The length of the string increase by 2.  Example:  nN ...

     ANNOVAR是一个高效的注释工具,能够利用最新的数据来分析各种基因组中的遗传变异。由perl编写,支持包括VCF在内的多种输入和输出文件格式。 主要包含三种不同的注释方法:gene-based, region-based 和filter-based...

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