生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写...
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标签: 生物信息学
我的生信心得分享
生信分析linux环境配置,安装分析软件环境,需要root权限
经常有小伙伴们会问到,**“我该如何入门生信”、“生信小白该怎么开始上手”、“不知道从哪里开始学”、“可以先不学R语言和Linux吗”**等等问题。其实入门这个问题叭,有点庞大,一句两句还真说不清!今天,咱们...
数据特征的选择是根据具体的项目进行选择的,不一定哪种数据特征提取的方法会好,也可以采用多视图特征融合的方法进行训练模型,以提高模型的性能。
PRS(Polygenic risk score)也叫PGS(Polygenic score)是在GWAS基础上发展起来的,PRS(多基因风险评分)是将与某种表型相关联的一组风险SNP的基因型效应加权来计算个体对该种表型(多指患病表型)的倾向的遗传学...
TCGA GEO数据处理,基因注释,差异分析,GO,KEGG,GSEA富集分析,肿瘤突变负荷,免疫浸润,LASSO回归,随机森林,SVM-RFE,COX回归,WGCNA网络,共识聚类分析,药物敏感性分析,干性指数,免疫浸润指数,预后模型等...
【生信】第一章 何为生信? 北京大学生信导论笔记,部分作手册自查使用。如有错误或遗漏还请海涵,可评论或邮箱联系。最后修改时间:2020-03-29 00:03:36 星期日 一、概述(Sequence alignment) DNA/基因组:如何...
你的这个文章虽然发了,但是只有技术,没有科学问题。但凡有点实验,做实验的就会抢一作。
生信常见数据格式.pdf生信常见数据格式.pdf生信常见数据格式.pdf生信常见数据格式.pdf生信常见数据格式.pdf生信常见数据格式.pdf
对于生信友好的杂志汇总,总共300多个杂志,包含接受量,影响因子等信息。
R语言中生物基因的富集分析 给生物信息学的爱好者
标签: 生信
生信数据库标准规范.pdf
整合了许多生信相关的网课链接,包括chip-seq信息分析,GEO分析高级教程多芯片联合分析,lncRNA芯片数据挖掘,TCGA基因表达和临床性状关系,TCGA基因差异表达分析转录因子调控网络,TCGA甲基化驱动基因高级课程
生信技能树的创始人做的,有需求下载。生信技能树的创始人做的,有需求下载生信技能树的创始人做的,有需求下载
通过生信分析挖掘在癌症中三个MiRNA,为肿瘤治疗提供靶点。
Bioinstrumentations involves biological variable measurements, this assists the physicians in treatment and diagnosis of their patients (Khandpur, 2004). In order to operate the equipment, electronics...
标签: 生信工具
生物信息分析基础软件,高通量测序,主要用于做质控分析
标签: r语言 Anosim
R语言生物信息分析之一 运用vegan加载包 进行Anosim analysis
该方法通过计算基因在样本间的差异表达,...这些差异分析方法在生信研究中发挥着重要作用,根据研究目的和数据类型的不同,选择合适的差异分析方法可以有效地鉴定差异基因或差异分子,并对生物学过程进行进一步的解析。
标签: python RNA数据
RNA数据格式转换脚本 在linux系统上使用python进行RNA数据格式转换
BioMercatorV4.2.jar 生信小工具
此软件用于calling SNP, 已经打包成zip,解压了之后可以直接用。
以上就是针对已知物种的miRNA分析。同时满足miRBase、miRTarBase和miRDB三个数据的物种,只有5种。因此针对未知的分析是重要的,而且在你时候的时候,可能会交叉使用。上面步骤中涉及了很多脚本,但都是很简单的文件...
开源生信 R 教程http://www.ehbio.com/Bioinfo_R_course/1 思考题2 R基础2.1 R安装2.2 Rstudio基础2.2.1 Rstudio版本2.2.2 Rstudio安装2.2.3 Rstudio 使用2.3 R基本语法2.3.1 获取帮助文档,查看命令或函数的使用...
python练习题 1 在文件中创建字符串nN Create 10 strings in a file, for each string, the first half is n and the last half is N. The length of the string increase by 2. Example: nN ...
标签: 生信注释软件
ANNOVAR是一个高效的注释工具,能够利用最新的数据来分析各种基因组中的遗传变异。由perl编写,支持包括VCF在内的多种输入和输出文件格式。 主要包含三种不同的注释方法:gene-based, region-based 和filter-based...