通过 前面十篇文章的学习,我们应该已经可以获取到一个”心仪的基因列表“了,相较于原始基因数量,这个列表的数量已经有了明显的缩小,为了进一步确定Hub gene 需要借助两个工具。使用STRING在线数据库进行PPI分析...
在生物信息学领域,Python是一种常用的编程语言,因为它具有易于学习和使用的特点,并且有很多强大的生物信息学库和工具可供使用。 关于Python生信练习题,引用中的代码是一个示例,指定了一个文件路径,并将其赋值...
随着学习的不断深入,分析的数据越来越多。你会发现,日常生信分析不过是调用一些相同的函数或者包分析不同的数据,换汤不换药。那么,如何把分析过程流程化,让数据像工厂的流水线一样自动被处理?最简单的法子,...
输入vi之后可以对文件进行修改,当我们输入vi进入界面之后,我们处于一般模式。在less下,输入/+需要查找的内容,可以立马显示出来。根目录中home是重要的目录,每一个链接到服务器的用户,均会在home中建立一个新...
本文主要向大家介绍了【云计算】LncRNA生信分析案例,通过具体的内容向大家展现,希望对大家学习云计算有所帮助。LncRNA的筛选做个笔记,哈哈哈这个流程是处于链特异性建库(dUTP)的RNA-seq流程,对于非链特异性建库...
生物信息几乎所有软件都由linux里面的命令行,你需要python或者一种scripting language 把一个个单独的命令串成一个script,这里有三四个事儿,数据格式转换这里是Perl和python的天下,R虽然都能干但是太慢了。...
20190727,在学习二代分析的过程中,只是根据别人已经建好的轮子照抄照搬,并不能真正理解每一步为什么要用这个软件,以及软件之间的区别。因此今天记录一些生信分析过程(主要是二代测序)中常用的软件,若有时间去...
win10自带子系统Ubuntu 安装方法详细记录 如果你恰好有相同的问题,欢迎阅读交流(●’◡’●)
它的原理是基于Transformer架构,通过预训练大量文本数据来学习如何生成人类可读的文本,然后通过接受输入并生成输出来实现对话。 ChatGPT的用途非常广泛,可以用于自然语言处理(NLP)任务,如对话生成、问答系统...
应健明的邀请,我也写一篇关于转行做生物信息的心得,本来以为很轻松就可以写出来的,但是发现并不那么好写...之前为了转岗,经常在业余时间学习编程和生信的知识,有时甚至在不是很忙的工作时间也学,但是由于背着...
那今天本文,就给大家剖析一下当生物信息遇见机器学习,会有什么火花。 那开始讲生物信息与机器学习之前,我们要先阐述几个概念: 1.什么是生物信息学的数据 2.什么是GWAS 什么是生物信息学的数据 研究的数据...
生信论文的套路ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析;临床标本从蛋白水平确认(或HPA数据库),很重要;Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性;cBio-portal数据库做基因组学的分析(机制一);...
TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库是一个大型的癌症基因组学项目,旨在通过对多种癌症类型的分子特征进行全面的分析,深入理解癌症的发生机制和发展过程。以下是关于TCGA数据库的一些重要信息:数据来源:TCGA...
作为一个生信er,光会处理文本数据是不够的,还要能进行统计分析。作为一个开源软件,R在统计社区“大行其道”,在生信分析人员中更是“一家独大”。为啥?因为R语言就是一群统计学家开发的,统计函数齐全,新的统计...
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生信开发人员最头疼的问题,可能就是平台搭建和软件安装了。部署和迁移上要费很大力气。本文讲述使用docker制作一个镜像,后续通过导入自己定制的镜像,复制文件完成分析流程的部署和迁移。 如何使用docker,推荐...