”生信学习“ 的搜索结果

     生信学习笔记：利用GATK call SNP SNP是指在基因组上单个核苷酸的变异,包括置换、颠换、缺失和插入。SNP在基因组中分布相当广泛，近来的研究表明在很多物种基因组中每300bp就出现一次。大量存在的SNP位点，使人们有...

     生信学习-高通量分析-MDS 多维尺度变换（multidimensional scaling，MDS） MDS与PCA非常相似，都是一种降维的方法。 MDS分为度量MDS（Metric Multidimensional scaling）和非度量MDS（Non-metric Multidimensional ...

     文章目录测序数据质控1.原始数据统计2.质控数据统计 测序数据质控 Illumina 测序属于第二代测序技术，单次运行能产生数十亿级的reads，如此海量的数据无法逐个展示每条read的质量情况；运用统计学的方法，对所测序列...

     分析来自 RNA-seq 的计数数据的一项基本任务是检测差异表达的基因。计数数据以表格的形式呈现，其中报告了每个样本已分配给每个基因的序列片段的数量。其他检测类型也有类似的数据，包括比较 ChIP-Seq、HiC、shRNA ...

     一、数据类型和向量 1. 数据类型 1.1 判断数据类型class() 1.2 按Tab键自动补全 1.3 数据类型的判断和转换 （1）is 族函数，判断，返回值为TRUE或FALSE is.numeric("123") is.character("a") is.logical(TRUE) ...

     由哈佛大学的Shaun Purcell开发的一个免费，开源的全基因组关联分析软件。1.数据提取，合并、提取特定SNP、样本、基因组某段区域的基因型3.；2. 数据（计算样本杂合度和SNP位点杂合度、最小等位基因频率MAF）3....

     Bioinstrumentations involves biological variable measurements, this assists the physicians in treatment and diagnosis of their patients (Khandpur, 2004). In order to operate the equipment, electronics...

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