上次谈到生信人员需要熟练掌握一些编程语言,还讲了Perl和Python的选择问题。那么,如果已经选定了一门编程语言,到底该如何学习它呢?今天的我们可以通过MOOC跟着名师学习或者上知乎提问,幸运的话还能得到大牛指点...
上次谈到生信人员需要熟练掌握一些编程语言,还讲了Perl和Python的选择问题。那么,如果已经选定了一门编程语言,到底该如何学习它呢?今天的我们可以通过MOOC跟着名师学习或者上知乎提问,幸运的话还能得到大牛指点...
在TGCA数据库中一个患者至多对应两个样本,但在原始选区的时候,一共是有多个样本可以选取的,从这多个样本中选取阴性(癌旁组织)和阳性(癌组织)最好的那个,当然,如果只有阳性或阴性的话,那么至多只有1个样本...
生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流...
1 Linux初探,打开新世界的大门1.1 Linux系统简介和目录理解1.1.1 为什么要用Linux系统 1.1.2 Linux系统无处不在 1.1.3 免费的Linux系统来一...
NMDS分析: 非度量多维尺度分析(Non-metric multidimensional scaling,NMDS)是一种将多维空间的研究对象简化到低维空间进行定位,分析和归类,同时又保留对象间原始关系的数据分析方法。一般用组间样本的秩次(数据...
如果想要从最原始的测序结果开始分析,如何分析? 转录组测序的分析流程大致可以分成三类,包括基因组比对( Genome mapping )、转录组比对(Transcriptome mapping)、转录组组装(Reference-free assembly)有大...
前言:记录在自学生信过程中所遇到的一些问题,如何去解决的。希望我的经验可以对他人有帮助。 注意:不要复制代码,因软件版本更新等问题,命令会变化的。重点学习怎么去解决问题。 一:执行zcat cz2_1.fq.gz...
代谢组检测 分析之 PLS-DA 偏最小二乘判别分析(Partial least squares Discriminant Analysis, PLS-DA) 偏最小二乘法判别分析是一种用于判别分析的多变量统计分析方法。 判别分析是一种根据观察或测量到的若干...
用conda安装bwa、samtools和tophat2 bwa $ conda install bwa samtools $ conda install samtools tophat2 安装 wget ...export
单端测序(Single-read)与双端测序(Paired-End) 一图看区别: 总的来讲就是单端测序只从一侧读,而双端测序是两头同时读然后拼接 单端测序(Single-read) Single-Read测序(Single-read)首先将DNA样本进行片段化...
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题,但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情。学习生信从来就不是一个简单的事,需要做好持久战的心理准备。在此...
如何你想成为一名生信人,那么至少你需要了解什么叫做生物信息学。否者,朝着错误的方向再努力也是白费劲。 什么是生物信息学呢?在陈铭主编的《生物信息学》(科学出版社)的序中是这样写的: 生物信息学是20世界...
生物信息学包含生物数据分析、数据可视化、重复工作程序化,是生物、医学科研必备的技能之一。生信宝典精心组织生信学习系列教程、生信工具精品教程,通过大量的生信例子、关键的注释、浓缩的语句和录...
而生信,恰好就是生物学和计算机的交叉学科,假如班上100个学生,你生物进前50名,那么在这50个人中,如果你计算机也能排前50%,那么你就进入前四分之一了。因此,跨界,是在职场上取得优势的捷径。 搞生信..
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个人学习笔记
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从这次开始我们就一步步开始学习了。掌握生物信息平台搭建这项技能并不会直接让你发文章,但是好处还是有的。至于到底有什么好处,我没法直接告诉你,很多东西是不可名状的。当你把整个过程跟下来以后,你自然会懂的...