我与 Galax...
但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需要...
一篇五分生信临床模型预测文章代码复现——Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润
关键词:转录组、生信、数据发掘 大规模转录组数据 常规转录组测序 转录组是一个细胞或者样本中全部的基因表达转录本信息,研究转录组是解析基因组中功能元件和生命活动的发生及调控机制的必要基础。 普通转
又是一个年度更新帖,主要是看到了粉丝留言,对我前面(2018及2019年)分享的个人计算机推荐 信息的更新:其中我是真的懒得给大家回答《我要做生信该买啥电脑呢》这样的问题,但是咨询的人实在是太多。工欲善其事必先...
rt=read.table(“input.txt”, header=T, sep="\t",comment.char = “”, check.names =FALSE) tb=table(c(as.vector(rt[,1]),as.vector(rt[,2]))) #对两列进行统计 #tb=table(as.vector(rt[,1])) #对一列进行统计//...
生信分析学习笔记:(2)GO KEGG分析介绍教程1、富集分析 (Over-Representation Analysis )2、GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)3、可视化实战练手项目 介绍 通常用的富集分析有ORA、FCS和拓扑三种方法。ORA...
生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题,但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情。学习生信从来就不是一个简单的事,需要做好持久战的心理准备。在此...
Windows系统使用xshell。
测序数据的表达矩阵通常包含了基因组数据分析的关键信息。一般来说,表达矩阵中的数据包括:基因表达水平: 表达矩阵中的每一行代表一个基因,每一列代表一个样本。矩阵中的每个元素通常表示相应基因在相应样本中的...
生信技能树miRNA-Seq学习笔记记录(一)
1.首先添加conda的镜像 conda的软件源有很多,其中专门收录了生物信息学软件的软件源,亦即bioconda。所以bioconda仅仅是conda的软件源之一,与bioconductor之于CRAN,bioperl之于CPAN是类似的。...
标签: 数据分析
最近在学单细胞的生信分析,学的有点懵。。。。先做点记录吧,后面在看看有什么要改的。说起来,生信分析的B站上怎么全是直到这基本流程就结束的。。看文献后面应该还有很多。。不知道怎么学了。
生信技能树-单细胞数据挖掘学习笔记 2.1
生信宝典推出的Linux从入门到常用命令、软件安装方法、数据处理方法都在这了。没有别的好招,常读,常练,记住了,练熟了,就会了;如果没有时间集中练习,可以来找我们做陪练。反响好的话,整理出一份完整电子版和...
经常有小伙伴们会问到,**“我该如何入门生信”、“生信小白该怎么开始上手”、“不知道从哪里开始学”、“可以先不学R语言和Linux吗”**等等问题。其实入门这个问题叭,有点庞大,一句两句还真说不清!今天,咱们...